项目管理软件能够给企业降本增效，然而企业如何选择适宜的项目管理软件则非常考验选型人员，因为企业隶属不同行业、处在不同阶段，对项目管理的要求都不一样，选择项目管理软件时的侧重点也就不一样。因此，企业在选择项目管理软件之前，除了需要厘清自身业务需求之外，还需要对软件类型和适用范围有一定了解，不同领域、不同的性能以及不同的部署方式，都有不同的选择。
1、按领域：工程类和非工程类
不同领域的项目有不同的特点，在项目管理中的侧重点也会有所不同。从大体上来说，项目管理可以分为工程类和非工程类两大类，工程类项目包括建筑工程、水利电力工程、装饰工程、工程施工等方面，涉及到设备、设计、物料的管理，专业程度高，管理范围和管理过程与非工程类项目管理迥异，因此工程类的项目管理软件自成一派。
非工程类项目管理软件应用的行业会更广泛一点，涉及到项目的计划、进度、资源、财务、文档等方面的管理，关注的重点一般在时间、效率和交付物质量等。非工程类的项目管理应用最为广泛的是三个领域：IT、产品研发、专业服务。IT项目主要指信息系统，为用户提供信息共享功能，同时，将硬件、软件、业务、信息、服务、人员有机结合起来，形成一体化网络管理平台，以整合信息资源，提高管理效率与经营效率。比如金融业的项目大多数是IT项目，通常来讲，会关注项目的全生命周期和项目流程的控制;产品研发包括制造业新产品研发和软件开发，制造业关注研发过程的跟踪和管理，软件开发行业则贯穿应用开发的全生命周期;专业服务项目包括咨询、营销、设计等领域，注重时间、人力和客户满意度。
2、按功能：团队协作类和企业级项目管理
针对不同的企业规模、管理成熟度，项目管理软件有不同的分类。
当企业规模较小、管理的成熟度不高时，企业可能不需要涉及到项目管理的全流程，而是更关注项目的进度、团队协作能力以及任务协同等部分流程，这个时候企业往往会选择轻量型的协作类管理软件，这类软件也有项目的概念，但是只关注项目的进度或任务层面，注重团队协作和任务管理，不需要经过专业系统训练的项目管理人才也能容易上手操作，使用门槛低。
与协作类项目管理软件相对的是企业级的项目管理软件，覆盖项目从立项到结项的全生命周期，并涉及到企业战略的落地。对于企业级项目管理来说，实现投资收益最大化是非常重要的，因此企业的成本、收益、资源分配是关注重点;而企业战略决定了企业的盈利模式和发展方向，企业级项目必须从战略出发。企业级项目管理软件涉及到项目的成本、团队、资源、组合、战略、收益等内容，适合管理成熟度高的企业使用，这类企业一般有专业的项目管理人员或PMO，企业规模也相对较大。
3、按部署方式：本地安装、云服务
软件的部署方式一般都分为本地安装和云服务两种，项目管理软件也不例外。本地安装需要部署服务器，成本较高、实施周期长但安全性较强;云服务部署则是部署在云服务器上，不需要运维步骤和成本，但安全性上不如本地部署。市面上的项目管理软件同时支持本地安装和云服务版本的也有不少，因此企业选择时更多的是考虑自身的项目管理情况。