随着国家提倡和推动科技创新，知识成果管理逐渐被企业管理者所重视，并已在企业项目管理中开始推广实施，在一些大型项目管理过程中也取得了一些显著成效，但是大多数企业在进行知识管理项目时还存在许多问题。
领导重视程度不足
虽然知识成果管理工作被大多企业列入企业经营管理运行中，但是处于市场经济体制下，一般企业的负责人只重视经济效益、年度经济指标的完成情况，对知识成果的重视度不够，这也是一些企业在知识成果管理上只能被动地流于表面工作的原因。
缺乏有效的管理手段
很多企业没有设置主管知识管理的部门，大多是挂靠别的部门或个人进行兼职管理。同时也没有把知识管理列入企业的技术发展规划。
很多企业已引进先进的管理工具，如项目管理ERP系统、OA办公系统、人力资源管理系统等，但未能很好地将其现代信息化技术管理工具的作用发挥出来，甚至在项目管理过程中，很多设计人员因技术更改或变更审批严格、流程麻烦，总想走捷径，以至于在项目研发生产过程中产生的知识成果不能得到有效的保存和延续。
缺少有效的制度保障
现代企业基本都建立了满足质量体系的有效运行制度，但很少有企业单独编制知识管理的相关制度。同时，企业对于技术创新、专利、成果转化等方面的激励制度不完善，并不能很好地结合薪酬考核体系来提升、调动员工的积极性，导致企业在推行知识管理、知识创新、专利申请、成果转化等工作时缺少有效的制度保障和动力。
缺乏专业性管理人才
现在大多企业为了降本增效，在实施企业运营管理、行政管理、项目管理过程中，往往采取多人兼职的方式，很少设置专门进行知识管理的部门和岗位，导致缺少具有知识管理理念、实施知识管理的团队和人员。
创新意识不强
创新是推动科技进步的动力和源泉，但是往往技术的创新和管理的变革也需要企业进行大量的成本投入。当前，在国家倡导技术创新、鼓励创新的环境下，企业的技术创新和变革有了明显的进步，但是大部分企业的创新意识不强，仍停留在过去的模仿模式，很少有企业根据自身的技术优势、技术缺陷、管理优势去进行主动创新，提升企业的核心竞争力。
没有形成浓厚的学术交流氛围
在一味追求经济效益的市场机制下，很多企业只注重产品、项目的完成情况，忽视了团队之间的交流;同时受老旧思想的影响，很多人员也不愿与他人分享自己掌握的先进技术和理念，没有形成良好的企业内部学术交流文化，严重影响企业技术发展的积累、继承和延续。